जर्नल ऑफ़ मॉलिक्यूलर बायोलॉजी एंड मेथड्स

स्तन कैंसर रोगी के सामान्य ऊतक में पोस्ट-ज़ाइगोटिक मोज़ेक उत्परिवर्तन

रयोंग नाम किम

हालांकि कई पिछली जांचों ने कैंसर ऊतकों में दैहिक चालक उत्परिवर्तनों पर नई रोशनी डाली है, लेकिन सामान्य से कैंसरग्रस्त ऊतकों में उत्परिवर्तन-संचालित घातक परिवर्तन तंत्र अभी भी रहस्यमय बना हुआ है। इस अध्ययन में, हमने 12 स्तन कैंसर रोगियों से युग्मित सामान्य और कैंसर नमूनों का संपूर्ण एक्सोम विश्लेषण किया ताकि पोस्ट-जाइगोटिक मोज़ेक उत्परिवर्तन को स्पष्ट किया जा सके जो स्तन कार्सिनोजेनेसिस के लिए पूर्वनिर्धारित हो सकता है। हमने सामान्य ऊतक में 2% वैरिएंट एलील अंश (VAF) के साथ एक पोस्ट-जाइगोटिक मोज़ेक उत्परिवर्तन PIK3CA p.F1002C पाया, जिसका मिलान किए गए स्तन कैंसर ऊतक में संबंधित VAF 20.6% बढ़ गया था। मिलान किए गए कैंसर ऊतक में वैरिएंट एलील अंश का ऐसा विस्तार स्तन कार्सिनोजेनेसिस के अंतर्निहित कारण के साथ मोज़ेक उत्परिवर्तन को जोड़ सकता है। पोस्ट-जाइगोटिक मोज़ेक उत्परिवर्तन को अच्छी तरह से स्थापित वैरिएंट एनोटेशन सॉफ़्टवेयर प्रोग्राम, SIFT_pred, Polyphen2_HDIV_pred, Polyphen2_HVAR_pred, LRT_pred, MutationTaster_pred, PROVEAN_pred, fathmm. MKL_coding_pred, MetaSVM_pred, और MetaLR_pred द्वारा हानिकारक माना जाता है। इसके अलावा, हमने उन रोगियों में 22 स्टॉप-गेन, 12 स्प्लिसिंग साइट, 13 फ्रेम शिफ्ट और 7 गैर-समानार्थी उत्परिवर्तन सहित 61 हानिकारक और रोगजनक उत्परिवर्तन की खोज की। उत्परिवर्तन हस्ताक्षर विश्लेषण करके, हमने स्तन कार्सिनोजेनेसिस के अंतर्निहित तीन उत्परिवर्तन हस्ताक्षरों की पहचान की, जिसमें APOBEC साइटिडाइनडेमिनेज और दोषपूर्ण डीएनए मिसमैच मरम्मत शामिल है। कुल मिलाकर, ये परिणाम सुझाते हैं कि, दैहिक चालक उत्परिवर्तनों के अतिरिक्त, पश्च-जाइगोटिक मोज़ेक उत्परिवर्तन एक महत्वपूर्ण लक्ष्य हो सकता है, जो आगामी भविष्य में स्तन कार्सिनोजेनेसिस के अंतर्निहित कारण का पता लगाने में पूर्व ध्यान देने योग्य है।