कृषि-पारिस्थितिकी तंत्र मॉडलिंग अपने आँकड़ों और सूचना सृजन के लिए कई भौगोलिक तकनीकों का उपयोग करके कृषि से संबंधित जानकारी का आकलन करने का भौगोलिक दृष्टिकोण है। हाल ही में कृषि-पारिस्थितिकी तंत्र मॉडलिंग में कृषि फसलों की उपज का अनुमान लगाने के लिए गतिशील फ़ज़ी मॉडल का उपयोग किया जाता है।
कृषि-पारिस्थितिकी तंत्र मॉडलिंग में कृषि-पारिस्थितिकी तंत्र की जैविक और भौतिक विशेषताओं और गतिशीलता, पारिस्थितिकी, कृषि प्रणालियों की विविधता और स्थिरता, कृषि-पारिस्थितिकी तंत्र और भूमि, वायु और पानी सहित प्राकृतिक पर्यावरण के बीच संबंध आदि जैसे बुनियादी विषयों को शामिल किया गया है।