जर्नल ऑफ प्लांट फिजियोलॉजी एंड पैथोलॉजी

अरेबिडोप्सिस थालियाना जीनोम में नाइट्रेट ट्रांसपोर्टर पैरालॉग्स की एक सरणी का स्पष्टीकरण

पंचशीला नोगिया, वंदना तोमर, गुरप्रीत कौर सिद्धू, राजेश मेहरोत्रा ​​और संध्या मेहरोत्रा

पौधे छोटे पैमाने पर दोहराव (एसएसडी) और पूरे जीनोम दोहराव (डब्ल्यूजीडी) दोनों के बाद जीन पैरालॉग प्राप्त करते हैं। पौधे दोहराए गए जीन को बनाए रखने और अपने जीन भंडार को बढ़ाने के लिए जाने जाते हैं जो उनके जीनोम के विकास में गहन रूप से योगदान देता है। आम तौर पर माना जाता है कि ऐसे पैरालॉग विकास में चुने और संरक्षित दोनों होते हैं क्योंकि वे अलग-अलग समय और स्थानिक पैटर्न में प्रोटीन के परिवर्तनशील स्तरों को व्यक्त करते हैं। अरेबिडोप्सिस थालियाना में, सिग्नलिंग और ट्रांसक्रिप्शनल विनियमन में शामिल पैरालॉग अक्सर जीन और जीनोम दोहराव की घटनाओं के बाद भी बरकरार रहते हैं। हमने अरेबिडोप्सिस थालियाना के जीनोम में एक आदिम नाइट्रेट ट्रांसपोर्टर जीन एनटीआर की दोहराव की घटनाओं का विश्लेषण किया। अधिकांश पैरालॉग्स ने उच्च, निम्न और दोहरे आत्मीयता वाले नाइट्रेट ट्रांसपोर्टर दोनों का कार्य प्राप्त कर लिया है, कुछ को नाइट्रेट के स्तर द्वारा स्वयं विनियमित किया जाता है और वे विभिन्न प्रकार के पौधों के कार्यों जैसे भ्रूण विकास, पार्श्व जड़ आरंभ का दमन, रंध्र उद्घाटन, जाइलम और फ्लोएम परिवहन और घाव प्रतिक्रिया आदि में शामिल होते हैं। वर्तमान विश्लेषण के लिए, 19 नाइट्रेट ट्रांसपोर्टर प्रोटीन अनुक्रमों को TAIR डेटाबेस से पुनर्प्राप्त किया गया और एक वेब सेवा उपकरण PINDA के साथ-साथ मैन्युअल रूप से विश्लेषण किया गया, जिससे समान परिणाम मिले। कई ट्रांसपोर्टर पैरालॉग्स के रूप में कार्य करते पाए गए क्योंकि उनके बीच निकट अनुक्रम समरूपता देखी गई। परिणाम इस विचार की ओर इशारा करते हैं कि उच्च पौधों में नाइट्रेट ट्रांसपोर्टर प्रोटीन का उप-कार्यात्मककरण जीन दोहराव घटनाओं की एक श्रृंखला के परिणामस्वरूप हुआ।