पौधों की रोग प्रतिरोधक क्षमता पौधों को दो तरह से रोगजनकों से बचाती है: पूर्व-निर्मित तंत्र द्वारा और प्रतिरक्षा प्रणाली की संक्रमण-प्रेरित प्रतिक्रियाओं द्वारा। रोग-संवेदनशील पौधे के सापेक्ष, रोग प्रतिरोधक क्षमता को अक्सर पौधे पर या उसमें रोगज़नक़ वृद्धि में कमी के रूप में परिभाषित किया जाता है, जबकि रोग सहिष्णुता शब्द उन पौधों का वर्णन करता है जो रोगज़नक़ वृद्धि के समान स्तर के बावजूद कम रोग क्षति प्रदर्शित करते हैं। रोग का परिणाम रोगज़नक़, पौधे और पर्यावरणीय स्थितियों की तीन-तरफ़ा बातचीत (एक बातचीत जिसे रोग त्रिकोण के रूप में जाना जाता है) द्वारा निर्धारित किया जाता है।