जर्नल ऑफ प्लांट फिजियोलॉजी एंड पैथोलॉजी

आईटीएस क्षेत्र अनुक्रम के आधार पर इन विट्रो केला कवक संदूषकों की पहचान और फ़ायलोजेनेटिक विश्लेषण

अनिमासौन, डी. ए.

पादप ऊतक संवर्धन बड़ी मात्रा में रोग मुक्त पौधों के तेजी से उत्पादन का एक साधन प्रदान करता है, हालांकि कवक संदूषण इसके सफल अनुप्रयोग के लिए एक प्रमुख बाधा है। इस अध्ययन ने इंटर-स्पेस (आईटीएस) क्षेत्र अनुक्रम के आधार पर इन विट्रो संवर्धित केले के कवक संदूषकों पर विशेषता, पहचान और फ़ायलोजेनेटिक विश्लेषण किया। कवक संदूषकों की शुद्ध संस्कृति से जीनोमिक डीएनए निकाला गया। आईटीएस 1 और आईटीएस 4 प्राइमरों का उपयोग करके पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन प्रवर्धन और इलुमिना लघु अनुक्रम आयोजित किए गए। न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमों को आम सहमति के लिए संरेखित किया गया और बेसिक लोकल अलाइनमेंट सर्च टूल (BLAST) का उपयोग करके NCBI जेनबैंक के साथ तुलना की गई। उच्च समानता अनुक्रम में मेगा 7 सॉफ्टवेयर का उपयोग करके अनुक्रमों के विश्लेषण ने संदूषकों के रूप में पांच एस्परगिलस एसपीपी, तीन पेनिसिलियम एसपीपी, कवक प्रजातियों के बीच कुल आनुवंशिक दूरी 0.205 थी और न्यूक्लियोटाइड प्रतिस्थापन की अधिकतम समग्र संभावना ने दिखाया कि थायमीन सबसे अधिक स्थिर है। कवक को 0.10 आनुवंशिक दूरी पर तीन प्रमुख समूहों में समूहीकृत किया गया था जो पाँच समूहों में विभाजित थे। पाँच एस्परगिलस उपभेदों का एक समूह और उप-समूह; तीन पेनिसिलियम उपभेदों का एक प्रमुख समूह; फ्यूजेरियम क्लैमाइडोस्पोरम और ट्राइकोडर्मा विराइड से युक्त एक समूह; और, एकमात्र कवक क्लैडोस्पोरियम टेनुइसिमम। एस्परगिलस समूह ए. फ्लेवस और ए. पैरिसक्लेरोटिजेनस से जातिवृंतिक रूप से संबंधित थे, पहचाने गए पेनिसिलियम एसपीपी पेनिसेलियम सिट्रिनम से निकटता से संबंधित थे जबकि पता लगाए गए क्लैडोस्पोरियम क्लैडोस्पोरियम टेनुइसियम और फोमा मल्टीरोस्ट्रेटा के साथ संरेखित थे। अध्ययन का निष्कर्ष है कि कवक संदूषकों की आणविक पहचान पारंपरिक तरीकों की कमियों को दूर करती है तथा उपलब्ध कराई गई जानकारी इन विट्रो संवर्धन प्रक्रिया के दौरान संदूषण को न्यूनतम करने के लिए विशिष्ट और प्रभावी बंध्यीकरण प्रोटोकॉल के विकास में सहायक हो सकती है।