जर्नल ऑफ प्लांट फिजियोलॉजी एंड पैथोलॉजी

फॉस्फोलिपिड इंटरैक्शन के लिए क्लास I और क्लास II प्लांट डिफेन्सिन में संरचनात्मक रूपांकन: लिगैंड बाइंडिंग और क्रिया के तरीकों की दिलचस्प भूमिका

गुइलेन-चेबल फ्रांसिस्को ए और एस्ट्राडा जॉर्जीना

फॉस्फोलिपिड इंटरैक्शन के लिए क्लास I और क्लास II प्लांट डिफेन्सिन में संरचनात्मक रूपांकन: लिगैंड बाइंडिंग और क्रिया के तरीकों की दिलचस्प भूमिका

डिफेन्सिन प्रकृति में व्यापक रूप से पाए जाने वाले धनायनिक रोगाणुरोधी पेप्टाइड हैं। पौधों ने कवक और अन्य रोगजनकों के संपर्क में आने वाले स्थिर जीवों के रूप में संक्रमण से निपटने के लिए तंत्र विकसित किए हैं। पौधों के डिफेन्सिन को संक्रमण के प्रति संवेदनशील अणु माना जाता है, फिर भी, कई अजैविक कारक उत्तेजक हैं और कार्रवाई के कई तरीके बताए गए हैं। फॉस्फोलिपिड बाइंडिंग प्रोफाइल क्लास I और क्लास II डिफेन्सिन दोनों की विशेषता है। क्लास I, MtDEF4 और क्लास II, NaD1 की एमिनो एसिड संरचना की तुलना करते हुए, फॉस्फोलिपिड लिगैंड के लिए संरचनात्मक अंतर या प्राथमिक संरचना के रूपांकनों का विश्लेषण किया जाता है, जिसके परिणामस्वरूप इस समीक्षा में क्लास I फॉस्फोलिपिड बाइंडिंग डिफेन्सिन की विशेषता के रूप में γ-कोर लूप के ग्लाइ अवशेष का प्रस्ताव किया गया है। चूँकि सोलानेसी पौधों में डिफेन्सिन के दो समूह मौजूद हैं, इसलिए तालमेल या ओवरलैपिंग फ़ंक्शन एक संभावना है। एन-टेर और γ-कोर लूप NaD1 वर्ग II डिफेन्सिन में फॉस्फोइनोसाइटाइड फॉस्फेटिडिलिनोसिटोल 4,5-बिसफ़ॉस्फ़ेट (PIP2) के 3D लिगैंड बाइंडिंग साइट को परिभाषित करते हैं, जबकि वर्ग I प्रतिनिधि डिफेन्सिन MtDEF4 के γ-कोर लूप में मूल अवशेष सेल में प्रवेश के लिए आवश्यक हैं। कैप्सिकम के डिफेन्सिन वर्ग I और वर्ग II डिफेन्सिन के विशिष्ट लिपिड बाइंडिंग प्रोफाइल के लिए संरचनात्मक बाधाओं को उजागर करते हैं। प्राथमिक और 3D संरचनात्मक रूपांकनों, विशेष रूप से 4 और 42 की स्थिति में अवशेष और व्यापक रूप से अध्ययन किए गए γ-कोर प्रोटीन-PIP2/PA बाइंडिंग के लिए इंटरैक्शन साइट में शामिल हैं, जबकि हाइड्रोफोबिक सतहों को झिल्ली या सेल दीवार घटकों के अतिरिक्त घटकों के साथ इंटरैक्ट करना चाहिए। फॉस्फोलिपिड बाइंडिंग के लिए 3डी बाइंडिंग पॉकेट से पता चलता है कि क्लास II के सदस्य इनोसिटोल रिंग में PIP2 के हेड-ग्रुप-फॉस्फेट को लक्षित करते हैं, जैसा कि NaD1 के लिए प्रदर्शित किया गया है, इस प्रकार चार्ज किए गए अवशेष MtDEF4 में भी फॉस्फेट लिगैंड समन्वय में शामिल होते हैं। मेडिकागो ट्रंकैटुला डिफेन्सिन के साथ फाइलोजेनेटिक संबंध सोलानेसी और लेग्यूमिनोसी में संरक्षित क्लास I पेप्टाइड रूपांकनों को दर्शाते हैं। यह समीक्षा स्फिगोलिपिड बनाम फॉस्फोलिपिड बाइंडिंग प्लांट डिफेन्सिन की क्रिया के तरीकों से संबंधित अत्याधुनिक स्थिति का सारांश प्रस्तुत करती है और सोलानेसी में परिपक्व पेप्टाइड क्लास I और क्लास II डिफेन्सिन के विशेष रूपांकनों को उजागर करती है जिन्होंने फॉस्फोइनोसाइटाइड्स और फॉस्फेटिडिक एसिड के लिए विशिष्ट बंधन दिखाया है।