आणविक नैनोटेक्नोलॉजी आणविक विनिर्माण का उपयोग करने वाली एक तकनीक है, जो मैकेनोसिंथेसिस के माध्यम से जटिल, परमाणु विनिर्देशन के लिए संरचनाएं बनाने की क्षमता पर आधारित है। इसमें आधुनिक मैक्रोस्केल कारखानों में पाए जाने वाले सिस्टम इंजीनियरिंग सिद्धांतों के साथ रसायन विज्ञान, नैनोटेक्नोलॉजी और जीवन की आणविक मशीनरी द्वारा प्रदर्शित भौतिक सिद्धांतों का संयोजन शामिल होगा।