यह जैविक लक्ष्य के ज्ञान के आधार पर रोग के उपचार के लिए नई दवाओं के आविष्कार की प्रक्रिया है। इसे तर्कसंगत औषधि डिज़ाइन के रूप में भी जाना जाता है। इसका उपयोग रोगी के चिकित्सीय लाभ के लिए किया जाता है। ड्रग डिज़ाइन जैविक लक्ष्य के आधार पर नई दवा की एक शानदार आविष्कारशील प्रक्रिया है। इसे तर्कसंगत औषधि डिज़ाइन या तर्कसंगत डिज़ाइन के रूप में भी जाना जाता है। महत्वपूर्ण चिकित्सीय प्रतिक्रिया प्राप्त करने के लिए चिकित्सा इतिहास में यह आविष्कार है। दवा एक कार्बनिक अणु है, जब इसे लक्ष्य स्थल पर बांधा जाता है तो यह बायोमोलेक्यूल के कार्य को बाधित या सक्रिय कर सकता है जिसके परिणामस्वरूप चिकित्सीय लाभ होता है। दवा के डिज़ाइन में ऐसे अणुओं का डिज़ाइन शामिल होता है जो आकार और आवेश में जैव आणविक लक्ष्य स्थल के समान होते हैं ताकि वे उससे जुड़ सकें। दवा का डिज़ाइन द्वि-आणविक लक्ष्यों की त्रि-आयामी संरचना के ज्ञान पर निर्भर करता है। संरचना आधारित दवा डिजाइन एक ऐसे यौगिक की पहचान करने के उद्देश्य से एक रासायनिक संरचना को डिजाइन करने की प्रक्रिया है जो नैदानिक परीक्षणों के लिए उपयुक्त है। इस प्रक्रिया में यह शामिल है कि चिकित्सीय गतिविधि उत्पन्न करने के लिए जैविक लक्ष्य के साथ कैसे आकार और आवेश बातचीत करते हैं। संरचना आधारित दवा डिजाइन सख्ती से तीन आयामी संरचनाओं पर आधारित है।