वायरल आनुवंशिकी विशेष रूप से मौजूद वंशानुगत जीन का अध्ययन है जो वायरल संक्रमण के लिए जिम्मेदार है जैसे कि जीनोम संरचना प्रतिकृति और कुछ प्रोटीन जो वायरल रोगजनन में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं।
आनुवंशिक चयन के परिणामस्वरूप वायरस लगातार बदल रहे हैं। उनमें उत्परिवर्तन के माध्यम से सूक्ष्म आनुवंशिक परिवर्तन और पुनर्संयोजन के माध्यम से प्रमुख आनुवंशिक परिवर्तन होते हैं। उत्परिवर्तन तब होता है जब वायरल जीनोम में कोई त्रुटि शामिल हो जाती है। पुनर्संयोजन तब होता है जब सहसंक्रमित वायरस आनुवंशिक जानकारी का आदान-प्रदान करते हैं, जिससे एक नया वायरस बनता है