पशु चिकित्सा विज्ञान एवं चिकित्सा निदान जर्नल

ब्रॉयलर में रियल टाइम आरटी-पीसीआर और एस1 जीन अनुक्रमण द्वारा संक्रामक ब्रोंकाइटिस वायरस उपभेदों की जांच

एंगिन अल्प ओनेन और याकूत ओजगुर

इस अध्ययन में, वास्तविक समय आरटी-पीसीआर द्वारा चिकन ट्रेकियल स्वैब के नमूनों से संक्रामक ब्रोंकाइटिस वायरस (आईबीवी) का पता लगाना, जिसे एक तीव्र और संवेदनशील वायरस का पता लगाने की विधि के रूप में रिपोर्ट किया गया था, का लक्ष्य रखा गया था। आईबीवी के एस1 जीन के हाइपर वेरिएबल क्षेत्रों (एचवीआर) की अनुक्रमण द्वारा आईबीवी के विभिन्न क्षेत्र और भिन्न उपभेदों में फाइलोजेनेटिक संबंधों को निर्धारित किया गया था। श्वसन लक्षणों के साथ 120 ब्रॉयलर मुर्गियों से ट्रेकियल स्वैब बेतरतीब ढंग से लिए गए थे। नमूनों को एसपीएफ भ्रूणयुक्त मुर्गी के अंडों के एलांटोइक द्रव (एएफ) में टीका लगाया गया था। एएफ द्वारा आरएनए निकाले गए थे। आरएनए को एसएस सीडीएनए में अनुवादित किया गया था। सकारात्मक नमूनों से सीडीएनए का इस्तेमाल एस1 जीन क्षेत्र में सी2यू और एजी0723 प्राइमरों के साथ एचवीआर (हाइपर वेरिएबल रीजन) के प्रवर्धन के लिए किया गया था। नमूनों को एस1 5'मॉड और सीके2 प्राइमरों द्वारा भी प्रवर्धित किया गया था। आरटी-पीसीआर उत्पादों को सीधे अनुक्रमित किया गया था। अनुक्रमण परिणामों की तुलना एनसीबीआई के न्यूक्लियोटाइड डेटाबेस से की गई है। अनुक्रमण परिणामों का मिलान जीन बैंक डेटाबेस में कुछ प्रकार के आईबीवी उपभेदों से 72-86% की दर से किया गया था। ये परिणाम समर्थन करते हैं कि हम प्रकार के आईबीवी उपभेदों का सामना कर रहे हैं। इसके अलावा, हमने संरेखण में बहुत सारे एसएनपी उत्परिवर्तन देखे। यह अध्ययन दिखाता है कि पक्षी आईबीवी प्रकार के उपभेदों से 27.5% की दर से संक्रमित हो सकते हैं साथ ही, हमने पाया कि ये प्राइमर सभी IBV फ़ील्ड स्ट्रेन को अनुक्रमित और वर्गीकृत करने के लिए पर्याप्त नहीं हैं। इस प्रकार, अलग-अलग प्राइमर विकसित किए जाने चाहिए और दो से अधिक प्राइमर जोड़े का उपयोग किया जाना चाहिए। इस प्रयोग में, हमने पाया कि SPF अंडे AF में IBV प्रतिकृति के कारण AF में वायरस का भार स्वाब नमूनों की तुलना में अधिक है। हमने 14 दिन के चूजे के भ्रूण में बौनापन और रक्तस्राव देखा