पशु आनुवंशिकी पशु चिकित्सा की एक शाखा है जो जानवरों में आनुवंशिकता और भिन्नता का अध्ययन करती है। यह सामान्य आनुवंशिक सिद्धांतों और अवधारणाओं पर आधारित है और यह मुख्य रूप से सामान्य आनुवंशिकी के संकर, साइटोलॉजिकल, जनसंख्या, ओटोजेनेटिक, गणितीय-सांख्यिकीय और जुड़वां तरीकों का उपयोग करता है। जानवरों में मुख्य रूप से लक्षणों की स्वतंत्र विरासत होती है क्योंकि उनमें बड़ी संख्या में गुणसूत्र होते हैं। लक्षणों की विरासत का अध्ययन करने की प्रमुख विधि संकर विश्लेषण है; यह कई रूपात्मक, शारीरिक और जैव रासायनिक लक्षणों की विरासत की प्रकृति को निर्धारित करने में मदद करता है, जो अक्सर जीन के कई जोड़े में से केवल एक पर निर्भर करते हैं। एक ओर इन जीनों और दूसरी ओर जानवरों की उत्पादकता, प्रजनन क्षमता और व्यवहार्यता के बीच संबंध पर शोध जारी है। जानवरों के दूध और रक्त के जैव रासायनिक गुणों पर काफी ध्यान दिया जाता है, विशेष रूप से इम्यूनोजेनेटिक्स पर, जिसके परिणामों का उपयोग शुद्ध नस्ल के जानवरों की वंशावली की जांच करने, विवादित मामलों में उनकी सटीक उत्पत्ति निर्धारित करने आदि के लिए किया जाता है। जैव रासायनिक गुणों के लिए जिम्मेदार जीन का अध्ययन करके, नस्लों की संरचना, उनकी रेखाओं और प्रजातियों का विश्लेषण करना और उनकी एकरूपता की डिग्री का न्याय करना संभव है। जानवरों में रूपात्मक दोषों और व्यक्तिगत अंगों के अविकसितता को आनुवंशिक शब्दों में समझाया गया है। कई विकास संबंधी दोष (जैसे कि बुलडॉग की उपस्थिति, बौनापन, और बछड़ों, खरगोशों और अन्य जानवरों में जलोदर) को तथाकथित घातक और अर्ध घातक जीन द्वारा निर्धारित किया जाता है। इन जीनों को धारण करने वाले व्यक्ति या तो मर जाते हैं या उनकी व्यवहार्यता कम हो जाती है।