बायोरेमेडिएशन एक अपशिष्ट प्रबंधन तकनीक है जिसमें दूषित स्थल से तटस्थ प्रदूषकों को हटाने के लिए सूक्ष्मजीवों का उपयोग शामिल है। बायोरेमेडिएशन एक "उपचार है जो खतरनाक पदार्थों को कम विषैले या गैर विषैले पदार्थों में तोड़ने के लिए प्राकृतिक रूप से पाए जाने वाले जीवों का उपयोग करता है"। बायोडिग्रेडेशन बैक्टीरिया, कवक या जैविक तरीकों से सामग्रियों का रासायनिक विघटन है, जबकि बायोडिग्रेडेबल का मतलब केवल सूक्ष्मजीवों द्वारा उपभोग किया जाना है, "कंपोस्टेबल" विशिष्ट मांग करता है कि वस्तु कंपोस्टिंग स्थितियों के तहत टूट जाए। सूक्ष्मजीवों के विविध समूह कार्बनिक संदूषकों के जैवनिम्नीकरण में शामिल होते हैं, और ये जीव यथास्थान स्थितियों के अनुकूलन और प्रतिक्रियाओं में व्यापक रूप से भिन्न होते हैं, जो स्वदेशी जीवों से जुड़े बायोरेमेडिएशन परियोजनाओं के प्रबंधन को जटिल बना सकते हैं। हालाँकि, क्या बायोरेमेडिएशन किसी दिए गए स्थल पर सक्रिय डिग्रेडर्स की पहचान के ज्ञान के साथ अलग तरीके से आगे बढ़ेगा? हाल तक, ऐसी जानकारी स्थापित करने में कठिनाई को देखते हुए, यह अक्सर चर्चा के योग्य प्रश्न नहीं रहा है, लेकिन इस उद्देश्य के लिए डिज़ाइन किए गए उपकरणों के आगमन के साथ यह बदल रहा है। पारिस्थितिक तरीकों में हाल की प्रगति के बीच, स्थिर आइसोटोप जांच के अनुप्रयोग, यथास्थान जैव निम्नीकरण में शामिल सूक्ष्मजीवों की पहचान स्थापित करने की क्षमता प्रदान करने के लिए प्रमुख हैं।