एप्लाइड बायोइनफॉरमैटिक्स और कम्प्यूटेशनल जीवविज्ञान जर्नल

होमोलॉजी मॉडलिंग

होमोलॉजी मॉडलिंग, जिसे प्रोटीन का तुलनात्मक मॉडलिंग भी कहा जाता है, अपने अमीनो संक्षारक उत्तराधिकार से "उद्देश्य" प्रोटीन के परमाणु निर्धारण मॉडल को विकसित करने का संकेत देता है। होमोलॉजी मॉडलिंग में हम संबंधित समजात प्रोटीन ("लेआउट") की त्रि-आयामी संरचना का परीक्षण करते हैं। अभिव्यक्ति "होमोलॉजी प्रदर्शन", जिसे समान प्रदर्शन या प्रारूप आधारित प्रदर्शन (टीबीएम) भी कहा जाता है, एक लेआउट के रूप में एक समरूप प्रोटीन की ज्ञात अस्थायी रूप से तय की गई संरचना का उपयोग करके प्रोटीन 3 डी संरचना का प्रदर्शन करने को संदर्भित करता है।

एक प्रोटीन संरचना प्रोटीन क्षमता, प्रगति, लिगेंड्स और अन्य प्रोटीन के साथ सहयोग और यहां तक ​​कि संरचना-आधारित दवा प्रकटीकरण और दवा रूपरेखा में फार्मास्युटिकल उद्योग के अध्ययन में अविश्वसनीय सहायता प्रदान करती है। होमोलॉजी प्रदर्शित करने से परमाणु शोधकर्ता और कार्बनिक रसायनज्ञों को "कम-निर्धारण" संरचनाएं मिल सकती हैं, जिसमें प्रोटीन में आवश्यक जमाओं की कार्रवाई के स्थानिक पाठ्यक्रम के बारे में पर्याप्त डेटा होगा और जो नई जांच की रूपरेखा को निर्देशित कर सकता है।

उदाहरण के लिए, यदि ऐसे "कम-निर्धारण" मॉडल संरचनाओं का उपयोग किया जा सकता है, तो साइट-समन्वित उत्परिवर्तन विश्लेषण की रूपरेखा को काफी बढ़ाया जा सकता है। प्रोटीन संरचना का परीक्षण चित्रण अक्सर पर्याप्त मात्रा में प्रोटीन (मिलीग्राम मात्रा की क्लोनिंग, अभिव्यक्ति और परिशोधन) प्राप्त करने में आने वाली समस्याओं, क्रिस्टलीकरण से जुड़ी चुनौतियों के कारण विलंबित हो सकता है, और यहां तक ​​कि प्रोटीन क्रिस्टलोग्राफिक भाग भी समस्याओं का स्रोत बन सकता है। इस सेटिंग में, यह आश्चर्य की बात नहीं है कि प्रोटीन संरचना के पूर्वानुमान का प्रबंधन करने वाली प्रणालियों में बहुत रुचि बढ़ गई है। इन तकनीकों के बीच, होमोलॉजी प्रदर्शित करने की रणनीति अक्सर सबसे भरोसेमंद परिणाम देती है। इस तकनीक का उपयोग इस धारणा के मद्देनजर है कि एक ही परिवार में रहने वाले और तुलनात्मक अमीनो संक्षारक उत्तराधिकार वाले दो प्रोटीनों में तुलनात्मक त्रि-आयामी संरचनाएं होंगी।