पादप जैव रसायन जीवित जीवों के भीतर और उनसे संबंधित रासायनिक प्रक्रियाओं का अध्ययन है। जैव रासायनिक सिग्नलिंग के माध्यम से सूचना प्रवाह और चयापचय के माध्यम से रासायनिक ऊर्जा के प्रवाह को नियंत्रित करके, जैव रासायनिक प्रक्रियाएं जीवन की जटिलता को जन्म देती हैं। आज, शुद्ध जैव रसायन का मुख्य ध्यान यह समझने पर है कि जैविक अणु जीवित कोशिकाओं के अंदर होने वाली प्रक्रियाओं को कैसे बढ़ाते हैं, जो सीधे तौर पर संपूर्ण जीवों के अध्ययन और समझ से संबंधित है।