विकासवादी प्रक्रिया को एक फ़ाइलोजेनेटिक पेड़ के रूप में पेश किया जा सकता है, और पेड़ पर जीवों का स्थान उस अनुक्रम की संरचना पर आधारित होता है जिसमें विकासवादी घटनाएं हुईं। फाइलोजेनी का लक्ष्य वैज्ञानिकों को कार्यात्मक जीनोमिक अनुसंधान के बारे में स्पष्ट दृष्टिकोण रखने में सक्षम बनाकर मौलिक जैविक प्रक्रियाओं की हमारी समझ को बढ़ाना है। फ़ाइलोजेनेटिक्स जीवों के समूहों के बीच विकासवादी संबंधों के विश्लेषण और जैविक, व्यवहारिक और सामाजिक प्रणालियों के अध्ययन के लिए कम्प्यूटेशनल सिमुलेशन तकनीकों से संबंधित है।