प्लांट प्रोटिओमिक्स पौधों के प्रोटीन के संपूर्ण पूरक से संबंधित है, जिसमें प्रोटीन के एक विशेष सेट में किए गए संशोधन भी शामिल हैं। प्रोटिओमिक्स एक विशिष्ट प्रोटिओम का गहन अध्ययन है, जिसमें प्रोटीन और उसके संशोधनों और विविधताओं की जानकारी शामिल है। प्रोटिओमिक्स एक अनुक्रमिक नेटवर्क में इंटरैक्टिंग साझेदारों और इससे जुड़े सदस्यों के साथ काम करता है।