रोग की अभिव्यक्तियों का अध्ययन करने के लिए ऊतकों की सूक्ष्म जांच की जाती है जिसे हिस्टोपैथोलॉजी के नाम से जाना जाता है। नैदानिक चिकित्सा में, कांच की स्लाइडों पर हिस्टोलॉजिकल अनुभागों को रखने के साथ-साथ नमूने को संसाधित करने के बाद, सर्जिकल नमूने की जांच एक रोगविज्ञानी द्वारा की जाती है जिसे हिस्टोपैथोलॉजी के रूप में जाना जाता है। हेमटॉक्सिलिन और ईओसिन का संयोजन हिस्टोपैथोलॉजी में सबसे अधिक इस्तेमाल किया जाने वाला दाग है। नाभिक नीला हेमेटोक्सिलिन द्वारा रंजित होता है, जबकि साइटोप्लाज्म और बाह्यकोशिकीय संयोजी ऊतक मैट्रिक्स गुलाबी रंग ईओसिन द्वारा रंजित होता है।