फाइलोजेनेटिक फाइलोजेनी, या जीवों के समूहों (जैसे प्रजातियां, या आबादी) के बीच विकासवादी इतिहास, विकास और संबंधों का अध्ययन है। इन्हें आणविक अनुक्रमण डेटा, और रूपात्मक डेटा मैट्रिक्स या विभिन्न समय पर विभिन्न प्रजातियों की भौतिक विशेषताओं के बारे में जानकारी के माध्यम से खोजा जाता है। फाइलोजेनेटिक पेड़ जीवों के समूहों या संबंधित न्यूक्लिक एसिड या प्रोटीन अनुक्रमों के परिवार के बीच विकासवादी संबंधों को दर्शाते हैं। फ़ाइलोजेनेटिक मुख्य रूप से भौतिक या रूपात्मक विशेषताओं जैसे आकार, रंग, पैरों की संख्या आदि से संबंधित है। आधुनिक फ़ाइलोजेनी आनुवंशिक सामग्री से निकाली गई जानकारी का उपयोग मुख्य रूप से डीएनए और प्रोटीन अनुक्रमों से करता है। उपयोग किए गए पात्र आमतौर पर डीएनए या प्रोटीन साइट होते हैं। प्रजातियों के बीच संबंधों को कई अनुक्रमों के संरेखण में अच्छी तरह से संरक्षित ब्लॉकों से निकाला जाता है, प्रत्येक जांच की गई प्रजातियों में से एक।