पौधों के सूक्ष्मजीव उपयोगी हो सकते हैं या हानिकारक सूक्ष्मजीव अपनी वृद्धि और अस्तित्व के लिए पौधों पर निर्भर होते हैं। पौधों में रोगजनक, सहजीवी और साहचर्य अंतःक्रियाएँ पाई जाती हैं। तनाव सहनशीलता, रोग प्रतिरोधक क्षमता और पौधों की उत्पादकता के लिए कुशल और लाभकारी पादप-सूक्ष्मजीव अंतःक्रिया की आवश्यकता होती है। विभिन्न पौधों की बीमारियों के जैविक नियंत्रण के लिए संभावित पौधों के रोगाणुओं का अलगाव लक्षण वर्णन आवश्यक है।