डीएनए हमारे शरीर की लगभग हर कोशिका में मौजूद होता है। त्वचा के टुकड़े, खून की बूंदें, बाल और लार सभी में डीएनए होता है जिसका उपयोग हमें पहचानने के लिए किया जा सकता है। वास्तव में, दुनिया भर के पुलिस विभागों और अभियोजकों द्वारा उपयोग की जाने वाली फोरेंसिक का अध्ययन अक्सर अपराधियों को उनके द्वारा किए गए अपराधों से जोड़ने के लिए शेड डीएनए के इन छोटे टुकड़ों पर निर्भर करता है। इस आकर्षक विज्ञान को अक्सर लोकप्रिय टेलीविज़न शो में अपराधी को खोजने और उसे न्याय दिलाने की एक सरल, सटीक और अचूक विधि के रूप में चित्रित किया जाता है। सच तो यह है कि, हालांकि, डीएनए फ़िंगरप्रिंट को छेड़ना और किसी संदिग्ध और अपराध स्थल के बीच मेल की संभावना का निर्धारण करना एक जटिल प्रक्रिया है जो अधिकांश लोगों की समझ से कहीं अधिक हद तक संभावना पर निर्भर करती है। सरकार द्वारा प्रशासित डीएनए डेटाबेस, जैसे कि संयुक्त डीएनए इंडेक्स सिस्टम (सीओडीआईएस), प्रक्रिया को गति देने में मदद करते हैं, लेकिन वे पीड़ितों और संदिग्धों के अधिकारों से जुड़े जटिल नैतिक मुद्दों को भी प्रकाश में लाते हैं। इस प्रकार, डीएनए साक्ष्य प्राप्त करने और विश्लेषण करने के तरीकों को समझना, यह साक्ष्य जांचकर्ताओं को क्या बता सकता है, और कानूनी प्रणाली के भीतर इस साक्ष्य का उपयोग कैसे किया जाता है, फोरेंसिक आनुवंशिकी के वास्तविक नैतिक और कानूनी प्रभाव की सराहना करने के लिए महत्वपूर्ण है।
हालाँकि, अधिकांश मानव जीनोम सभी व्यक्तियों में समान है, भिन्नता के क्षेत्र भी हैं। यह भिन्नता जीनोम में कहीं भी हो सकती है, जिसमें वे क्षेत्र भी शामिल हैं जो प्रोटीन के लिए कोड के लिए ज्ञात नहीं हैं। इन गैर-कोडिंग क्षेत्रों की जांच से डीएनए की बार-बार इकाइयों का पता चलता है जो व्यक्तियों के बीच लंबाई में भिन्न होती हैं। वैज्ञानिकों ने पाया है कि एक विशेष प्रकार की पुनरावृत्ति, जिसे शॉर्ट टेंडेम रिपीट (एसटीआर) के रूप में जाना जाता है, को अपेक्षाकृत आसानी से मापा जाता है और विभिन्न व्यक्तियों के बीच तुलना की जाती है।
फोरेंसिक डीएनए विश्लेषण करने के लिए, सबसे पहले एक नमूने से डीएनए निकाला जाता है। डीएनए का केवल एक नैनोग्राम आमतौर पर अच्छा डेटा प्रदान करने के लिए पर्याप्त मात्रा है। प्रत्येक एसटीआर वाले क्षेत्र को फिर पीसीआर द्वारा बढ़ाया जाता है और आकार के अनुसार हल किया जाता है, जिससे एसटीआर आकार (एलील) की समग्र प्रोफ़ाइल मिलती है। 13 कोर एसटीआर की लंबाई 100 से 300 आधारों तक भिन्न होती है, जिससे आंशिक रूप से अपमानित डीएनए नमूनों का भी सफलतापूर्वक विश्लेषण किया जा सकता है। रिपीट यूनिट की जटिलता के आधार पर, एसटीआर के विभिन्न एलील्स एक न्यूक्लियोटाइड जितना कम भिन्न हो सकते हैं। एकल-बेस अंतर को अलग करने की आवश्यकता के कारण, पीसीआर उत्पादों को आमतौर पर सॉफ्टवेयर के साथ स्वचालित डीएनए अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों का उपयोग करके हल किया जाता है। ज्ञात "सीढ़ी" की तुलना में एलील पैटर्न को पहचानता है।