प्रोटीन प्रौद्योगिकियों में प्रोटीन संरचना और कार्य के लक्षण वर्णन, गुणात्मक और मात्रात्मक अध्ययन के लिए कई तकनीकें शामिल हैं। इनमें 2-डी इलेक्ट्रोफोरेसिस, इमेज डिटेक्शन और डेटाबेस सर्च जैसी कई तकनीकें शामिल हैं। रुचि के प्रोटीन की भविष्यवाणी में प्रोटिओमिक्स तकनीक के कई फायदे और थोड़े नुकसान हैं। ये तकनीक पूरी तरह से तकनीकी प्रगति पर निर्भर करती है जो हजारों अद्वितीय प्रोटीनों के त्वरित विश्लेषण की अनुमति देगी।