प्रोटिओमिक्स बड़े पैमाने पर प्रोटीन का एक अध्ययन है जो ज्यादातर जीनोम पैमाने पर इसकी संरचना और कार्य पर ध्यान केंद्रित करता है। प्रोटीन संरचना का अध्ययन करने के लिए एमएस स्पेक्ट्रोमीटर, इलेक्ट्रोफोरेसिस जैसी कई तकनीकें विकसित हुईं। प्रोटिओमिक्स यह समझने में मदद करता है कि प्रोटीन विभिन्न चयापचय मार्गों में एक साथ कैसे काम करता है, साथ ही इसके नियामक तंत्र में मदद करता है और रुचि की डिज़ाइन की गई दवा के दुष्प्रभावों की भविष्यवाणी करने में मदद करता है।