यह प्रोटीन की संरचना से लेकर कार्य की भविष्यवाणी तक का अध्ययन है। इस अध्ययन में प्रोटीन की पुष्टि और प्रोटीन से प्रोटीन अंतःक्रिया के दौरान परिवर्तनों के लक्षण वर्णन के अध्ययन पर ध्यान केंद्रित किया गया है। संरचनात्मक प्रोटिओमिक्स संरचनात्मक जीव विज्ञान की एक प्रसिद्ध पारंपरिक रूप से श्रमसाध्य प्रक्रिया है, जिसमें एक्स-रे क्रिस्टलोग्राफी या परमाणु चुंबकीय अनुनाद (एनएमआर) या 2 डी जेल का उपयोग किया जाता है। वैद्युतकणसंचलन