जीन प्रोफाइलिंग एक समय में हजारों जीनों की गतिविधि का माप है या सेलुलर फ़ंक्शन की पूरी तस्वीर बनाने के लिए है। जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइलिंग विशिष्ट परिस्थितियों में या किसी विशिष्ट कोशिका में सेलुलर फ़ंक्शन की वैश्विक तस्वीर देने के लिए प्रतिलेखन के स्तर पर व्यक्त जीन के पैटर्न का निर्धारण है। किसी जीव की लगभग सभी कोशिकाओं में जीव का पूरा जीनोम होता है, उन जीनों का केवल एक छोटा सा उपसमूह किसी भी समय मैसेंजर आरएनए (एमआरएनए) के रूप में व्यक्त किया जाता है और उनकी सापेक्ष अभिव्यक्ति का मूल्यांकन किया जा सकता है। प्रोफाइलिंग में शामिल तकनीकों में डीएनए माइक्रोएरे तकनीक या अनुक्रम-आधारित तकनीकें जैसे जीन अभिव्यक्ति का क्रमिक विश्लेषण शामिल हैं।